キャラクターを３D化するにあたって、その制作に３Dモデラーの創意工夫があれば、３D化されたキャラクターは元のキャラクターとは別の著作物として３D化されたキャラクターの著作権は３Dモデラーにも帰属します。あなたの例での３Dモデル化でモデラーの創意工夫があるかはこの場では判断できませんが、創意工夫があるのでしたら、３D化されたキャラクターの著作権を主張してくることは不思議ではありません。 ご相談内容のような製作依頼にあたっては、著作権を整理したうえで費用について事前に制作それ自体と著作権譲渡の対価を整理して決めて契約すべきですし、事前の取り決めなどをしていなかったために争いになっている例も散見されます。 あなたのこれまでの経験で問題とならなかったのは、モデラーの側も著作権の権利をよくわかっていないのか、または黙示的に著作権譲渡込みの費用の認識だったからにすぎないようには思われます。 著作権の関係でプラスの費用を請求されているのでしたら、まず３D化で別の著作物として権利が発生する物なのか、発生する場合は著作権の整理の意味でも費用を含めて話し合いをするほかにないでしょう。