血縁関係のDNA鑑定

立会人が居ない中で血縁関係のDNA鑑定をする事になったのですが、父親は子供に対してよく思ってないようで他人の検体を提出されて捏造されないか不安です。そのような事は有り得るのでしょうか?
また、そのような事が起こった場合はどうするべきなのでしょうか。

あり得ないとは言い切れません。DNA鑑定は特に、サンプル採取の場面がネックになります。
鑑定業者の中にはそれを理解してサンプル採取をしてくれたり立ち会ってくれたりする業者もいるので、DNA鑑定業者に相談したほうがいいと思います。