喧嘩別れ後に迫り退職した。

本日、元交際相手から会社の上司に話され退職しました。
実は1月初旬に喧嘩し別れ、あまりにひどい言葉を言われたので翌々週ぐらいに第三者を通して話そうとLINEしました。
それを同じ会社で部署は違いますが私の会社の上司に相談しており私も未練があったので先週しつこく連絡してしまいその時の事を謝りたいと思い家に行ってしまいました。
そしたら今日上司から示談書を出され、ストーカー的な内容の示談書を書かされました。
実は彼女から暴力を受けた事もあり、それについてもドライブレコーダーの音声ぐらいであれば確認出来ますが正直納得いきません。
なぜ私だけ退職なのかという所、何かアドバイスいただけますか?

会社は、職場環境配慮義務の一内容として、社内でのストーカー被害に対して適切に対応する義務があります。

懲戒免職も選択肢としてありえないわけではありませんが、最も重い処分です。
これまでの会社の対応状況次第では、違法な懲戒権の行使ともなり得ますので、納得がいかないということであれば、一度お近くの法律事務所に直接ご相談されてみてください。

交際中殴られた事に関しては問題とされないでしょうか?

本来であればその場で被害届を出しておくべきでした。
今からその点を問題視するとしても、暴行を受けた証拠が十分かは検討する必要があります。

会社の対応状況次第とはどんな事をいうのでしょうか?
何度も申し訳ありません。

私の方から何か具体例を挙げさせていただくよりも、
お近くの法律事務所で面談され、起こったことをありのままお話いただくほうが適切ですし、スムーズかと思います。