免許費用は全額返還しなければいけないのでしょうか、そして裁判の場合勝ち目はないでしょうか

去年4月頃に個人事業主の委託という形で入社し業務に必要だからと言われ2種免許を会社負担で取得しました。
その際2年以内に辞めた場合は全額返還する事という契約書に署名しました。

今年の4月にその会社が個人事業主から株式に変わった為契約社員になり数ヵ月後には社員に変わりました。
今年4月頃に社長から高圧的な態度やパワハラを受けていたのですが耐えていました。
社員に変わる際にも揉めて契約は終わりでもいいという話まで出たのですが口頭で社長から『ボーナスを100万出すので続けて欲しい』と言われ契約は継続していました。
(その100万は引き止める為の嘘でした)

先日社長と揉めてメッセージで『ハズレ人材だった』や『これ以上話すと負のオーラが移る』や『人としてやばすぎる』等の言葉を言われ、一従業員には出来ないような社用車を売却手続き、閉業手続きをしてから辞めろと言われました。

揉めた次の日も出勤日だったので出勤をしたら普段停めている駐車場が停められないようにしてあったり事務所に入れないようにチェーンをかけられていました。
(チェーンに関しては会社のグループLINEに詳細は送っていたみたいですが揉めた日にグループLINEを消せと言われて消していた為こちらは見れない情報でした)

社長に連絡しても繋がらなかった為着信拒否されたのだと思い家族に助けを求め代わりに社長に連絡して貰いました。
その際の電話内容が、『飛ぶと思ってた、今日辞めるなら辞めるでいい、クリーニングはこちらでします、家族が出てくるのは初めてです、離職票に色々書くけど文句言ってこないでください』
こういった内容でした。
その後家族がメッセージでもやり取りしたのですが『免許費用を全額返還して、社用車の私的利用は横領なのでその費用も請求する、社外秘なので契約書のコピーは渡しませんし原本も確認させません、こちらに足を向けた以上裁判でもなんでもします』と言われました。
こちらから契約書を確認させて欲しいと連絡しても頑なに断ってきます。
後日弁護士から連絡が来ますので弁護士通して連絡お願いしますと言われたので待っていたら書留で退職届や契約書や請求額が届きました。
これは弁護士からではなく会社からでした。
契約書内には(同じ職種に3年働かない、業務に関して連絡があれば協力する、法的処置にもこちらが協力します)といった内容でした。

支払わなければ少額訴訟をすると言われています。

上記が詳細になるのですが免許代は全額返還しなければいけないのでしょうか。
そして人格否定や業務上出来ない仕事をふられたり等されているのですがパワハラにならないのでしょうか?

社用車の私的利用に関しては【私的利用を認める、ただし何に使うかは報告しなければいけない】といった契約書に署名しています。
そして報告もしていたのに一切報告が無かったと嘘を言われています。
生理痛が酷く今までの経験からして次の日も治まらないと分かったので前日に休み申請をしたら『前日に連絡するのはありえない、半日経ったら治るかもしれないのに何故今なのか、経験なんて保証にならない』と言われました。

労働問題(労働者側)に詳しい弁護士へ相談・依頼されることをお勧めします。
ご質問を読んだ印象としては、会社(社長)の言うことは法的に理由が乏しく、免許費用については勝ち目はあると思いますが、パワハラと認定出来るかどうかは事情次第ではないかと思います。
ここは誰でも見ることができる公開の場であり、説明が具体的であるため事案を特定されるおそれがあります(関係者が読めばおそらく誰が投稿したかが推測できるでしょう)。ネットの相談よりも、直接弁護士へ相談して弁護士を代理人として対応した方がよりよい解決に繋がると思います。

回答ありがとうございます。
念の為投稿が消せるか試してみます。
内容を簡潔にし再度質問したいと思います。