この場合どうなりますか?刑事事件までなりますか?自分から申告し、懲役解雇➕返済したらよろしいですか?

4年勤務しているバイト先でポイント横領してしまいました。
私は勤務中、ポイントカードの不正操作に関して問題が発生しましたので、事実関係を整理してご報告します。約1か月間、土日の勤務中に、自分の買い物分(20ポイント、約4,000円)とお客様のポイント分(276ポイント、約55,200円)を含む合計296ポイント(約59,200円相当)が自分のカードに加算しました。行為は複数回発生しましたが、自分の行動は不正であり、会社に迷惑をかけました。

会社の状況として、本部は不正を怪しんでいる一方で、オーナーからは「今は何もせずに待つように」と指示されています。
この件について、刑事事件化を避けるための対応策、内部処分で済ませる場合の適切な手続き、そして返還や反省の意思を示す方法について相談したく、ご助言をいただければと思います。

被害者が捜査機関に被害届の提出又は刑事告訴を行えば、刑事事件になる可能性がやや高いように思います。
被害金額の返済に加えて謝罪を示す示談金の支払いを提案し、被害者との間で示談を締結するのが良いように思います。
被害者が加害者を許し、被害届を提出しないと記載された示談書が締結されている場合、捜査機関が積極的に捜査する可能性はかなり低くなります。

刑事捜査となる前に弁護士に依頼することをおすすめします。