困っています。被害届 冤罪

月曜日、学童保育で年中の息子を繰り返しいじめる小5の子を注意したら、家庭で首を掴まれて傷がついたと話し、保護者が被害届を出したとの話がありました。確かに厳しく注意しましたが、指一本触れていません。しかし、近くにいた子もグルになって、保育園の聞き取りに、掴まれてるのを見たと証言しています。
私は公務員なので、一応上司には報告しましたが、この後の展開がどうなるのか心配です。
絶対に手は出していないのですが、やってないのを見ていたのは近くにいた小1の娘だけで、他に誰も見ていません。
警察から呼び出しがあっても、絶対にやってないで通しますが、悪魔の証明というやつで、やってないことを証明するのが難しい状況です。
どうしたら良いでしょうか?
弁護士に相談するタイミングはいつでしょう?
また、こちらに冤罪をなすりつけるならば息子をいじめた件を被害届を出すことは可能でしょうか?

あなたの側で、「やっていないことの証明」をする必要はありません。
仮に刑事事件となるのであれば、捜査側が「やったことが確実」と言えるだけの証拠を集められなければ、ほぼ裁判にはなりません。

弁護士には、早目に相談しておいた方が良いと思います。
遅くとも、警察から呼び出しが来た場合には、警察での取り調べ(事情聴取)前には、弁護士に相談しておいた方がよいです。

お子さんをいじめた件について、被害届を出して受理されるかは、暴行等の「内容次第」だと思います。
相手に対する「報復的な意味」で行うのであれば、被害届を出すことはお勧めしません。

絶対にやっていませんが、首を掴んで傷がついたと主張しているみたいです。
勝手に傷をつけて診断書をとるという手を使う可能性があります。DNA鑑定でも求めたいところです。