借用書がない場合泣き寝入りでしょうか?

妹の二回目の旦那に立て替えたこれまでに払った養育費を返済してほしいです。借用書を交わそうとした時に逃げて連絡も取れない状況です。会社は突止めてます。こちらは今までかかった明細は準備できます。

相手が任意に支払をするのであれば借用書は必要ありません
相手が支払をしないのであれば貸した側で貸付をした事実と金額を証明する必要があります。明細の他に、振込履歴など貸付けをを証明できるようなものが何かないか探してみてください。
具体的内容はケースバイケースとなり、こちらではお伝えが難しいため、弁護士にもご相談されることをお勧めします。

預金の履歴やメールなどのやり取りから貸したことを証明できるなら、支払督促か訴訟提起をしたのちにそれでも支払わなければ給料の差し押さえという手段を取れると存じます。具体的な手順は弁護士に相談することを進めます。