苗字を変えたいです。

現在29歳です。21、2歳の頃に両親が離婚しました。離婚理由は父親が親戚のお金を盗んでいたことが発覚したからです。離婚後母親は自分の旧姓に戻しており、私は苗字は昔から変わっていません、父親の方の苗字のままです。ただ、他の姉弟は結婚して除籍されており、わたしだけずっと苗字が変わらないままだと父親がまた何かしでかしたら私の方に連絡など色々来るのではないかと怯えています。
この場合、母親の苗字に変更することは可能なのでしょうか?

可能です。
家庭裁判所に氏の変更許可申立てをしてください。
https://www.courts.go.jp/saiban/syurui/syurui_kazi/kazi_06_07/index.html