休職期間満了後、復職できない場合。

現在休職中です。会社から就業規則に準じて、自然退職と告げられました。
しかし私は業務中の社員や会社の対応で精神疾患が悪化し休職することになりました。
私の場合会社が原因で休職することになったので、休職期間満了後、復職できない場合でも自然退職は無効ですよね?
ご回答のほどよろしくお願い致します。

休職の原因が会社にあると認められる場合であれば、休職期間満了による退職や解雇が不当解雇として違法となる可能性はあるでしょう。

メールで経理担当の人に告げられました。
メールの返信で休職の原因が会社なので、自然退職できません。と返信しても大丈夫でしょうか?