会社が従業員に補助金立替を要求するのは法令違反か?

仕事の内容が購入すれば補助金が顧客に支給される商品の販売会社

インバウンドや訪問での営業がメインとなるが案件の殆どで販売会社である当社からの補助金申請が必要。
会社の規模が大きくなく、事務員も存在しない為、営業した者が補助金の申請を実施。
年間150件程度実施するが、繁忙期になると申請が追いつかない状況になってしまい、顧客側からクレームが入る。
会社側に入る補助金を一旦立替とし、顧客に先に払い出すという形でクレームは治るが、この立替費用を従業員に請求される。
1件あたり10万円以上する補助金の為、生活にも影響する額を払い出しもしくは給与から天引きという会社は法令違反ではないでしょうか。

違法でしょう。給料は全額請求可能です。
遅れながらも入れてくれるのでしたら、裁判沙汰にするほどではないかもしれませんが(返ってきてるときは実損害が無いので)、違法は違法ですので、労基署に連絡相談などされるのがよいでしょう。