会社金庫の盗難事件で起訴の可能性と今後の対応について

先日、会社の金庫のお金を約5万円ほど盗んでしまい、防犯カメラに映っていたこともあり、もちろん会社もクビになりました。
この間警察から任意の取調べを受けてきました。その日は取り調べ、指紋採取、写真を撮って帰ってきました。
書類送検されるとのことで、盗難罪と書いてありました。
あとは検察官が起訴か不起訴か決めるとのことなんですが、少し前に、謝罪文を社長と店長宛に送りました。まだ返事は返ってきておらず、お金もいくら返していいのかわからないので、お金もまだ返していません。
初犯です。前科もありません。
警察からは、「あとは検察署から呼び出しがあると思います。それは1ヶ月後かもしれないし、半年後からもしれません」と言われました。
起訴されてしまうのでしょうか。
本当に反省しています。

あと、他に何かやっておいた方いいことありますでしょうか?
できれば示談にしたいのですが、、
たぶん相手側はそれを望んでいなそうです。

被害弁償が未了、被害額、被害者の処罰感情などを鑑みると、相応の処分がなされる可能性が見込まれます。

可能であれば、被害弁償だけでも行われるべきだと思われます。
相談者さんが弁済を申し出ると被害者が受け取りを拒否する見込みの場合、弁護士に依頼されるか、供託手続を検討されてみてもよいでしょう。
最寄りの法律事務所に相談だけでも行かれることをお勧めします。