懲戒解雇と退職願いについて

3年前に生活費が足りなく店の金を使用していまい横領してしまいました。社長、取締役に事情を説明して温情で警察には突き出されず借金も社長が立て替えてくれました。
立て替えてくれた借金は残り数ヶ月で返済が終わりますが、返済完了後に退職願いを出した場合懲戒解雇、もしくは通報される可能性は高いですか?

可能性の話ですが、
社長や取締役に対して、恩義があることを肝に銘じて、退職の相談をすれば、
いまさら通報はしないように思います。
退職は、自己都合退職になるでしょう。
懲戒解雇は控えると思いますね。
恩義だけは忘れずにご自分の退職の気持ちを伝えることでしょう。
なお、返済完了後と言えども、慰謝料の要求があるかもしれません。