書面での指導改善に値するのでしょうか

一昨日のことです。私はフィットネスジムの店長をしています。
上司より残業の仕方について電話にて指導を受けました。
会社からは残業をしても良いが、計画的に行うよう指導されています。
先月業務が遅滞していたので、上司報告をし残業見込みが10時間以上かかる旨を報告し
許可を得ました。
(結果として残業時間は10時間を少し超えました。)
私は早出出勤を行って、溜まった業務を定時より早く出社して処理していましたが、
上司より早出をしているのは、計画的ではない残業ではないか、との指摘を受けました。
私は毎日20分、30分と少し早めに来て遅滞業務を処理していましたが、
上記のように計画的に残業をしていないのではないか、
との趣旨で指導受けました。出勤時間が一定でないので
なんとなく早く来て、なんとなく業務をしているのではないかとのことです。
(私は心療内科に通院しており、医師より少しずつでもいいので、仕事をこなし無理をしないようにしてください。と指導を受けていました。)
上記内容を説明しましたが、そういったことを出されると指導できなくなる、といって
お聞き入れ頂けませんでした。
今後書面での指導を行うとのことですが、(記録に残す。過去5年に遡って調査すると言われました。)今回の残業(早出業務)は書面での指導にあたるものでしょうか。上司よりこういった
指導を受け、戸惑っています。こういった指導はやむを得ないのでしょうか。
今回の件で降格や人事上マイナスの影響を記録として残されるのに不安をかんじています。
アドバイスをよろしくお願いします。

書面での指導とは、「懲戒処分」ではないということを前提に回答します。

会社側としては、きちんと指導していることを後に証明できるように「書面」で指導を行うことを
検討したのだと思います。やむを得ない措置と思われます。

なるほど、やむを得ないのですね。
わかりました。ありがとうございます。
頑張ってみます。