海外滞在かつ在留期限過ぎの場合、在留資格を更新できないか

妻は外国籍であり、在留資格は永住者の配偶者で、在留期間は今年の7月28日までです。(私は永住者です)
妻は現在海外滞在中で、7/28の前に日本に戻る予定です。
万が一の話ですが、帰国の前にコロナに感染してしまい、予定通りに日本に帰れず、在留期限の7/28も過ぎてしまう場合は、どうすれば日本に帰れるかを知りたいです。
(在留期限を過ぎて本人も海外に居る場合は、在留資格を更新できないと存じていますので)

一応確認ですが、更新申請はしていますよね。まさかギリギリに戻ってそれから申請するということではないとは思いますが。

申請しているなら、結果が出るか、在留期間が満了した後2ヶ月間のいずれか早い日までは在留資格ありますので少々遅れても大丈夫だと思います。コロナで2ヶ月も帰国が遅れることはまずないのではないでしょうか。