住居手当について(公務員)

妻と仕事の都合上別居しています。
私は実家暮らしで、連休日に妻子が住んでる家(賃貸契約、支払い等私名義)に帰宅していますが、賃貸住宅からの通勤実態がない(片道100キロ以上のため通勤許可が出ません)ので住居手当が支給されていません。
この場合は法的(条例になると思いますが)に支給されないのが妥当なのかご回答お願いします。

職業は公務員です。

一般論ですが、ご自身が実際に居住されていない物件について住居手当がでるということはないのではないでしょうか。

ご納得いただけない場合は、国家公務員であれば人事院に、地方公務員であれば県にお問い合わせされてみるのも一つかと思います。

通勤ができないため住民票を移してないだけです

あなたが所属している自治体の定める例規を確認できないので、何とも申し上げられませんが、現在の状況が、例規に特段違反しているものではないのであれば、法的には問題がないということになります。