教えてくださいお願いいたします

去年の8月にパチンコ店に3キロのゴミを不法投棄してしまい警察の取り調べが去年の二回しかしていなず3ヶ月過ぎに連絡が来ましたが
去年のうちにお店の人に謝罪して許しを得たのですがそこから警察からの任意の取り調べを拒否した場合起訴になりますか?

>去年のうちにお店の人に謝罪して許しを得たのですがそこから警察からの任意の取り調べを拒否した場合起訴になりますか?

本件でどうか、というのはなんとも言えませんが、

一般論として、任意取調べを拒否すると逮捕されたり、
起訴されたりしやすくはなります。