弟の籍を抜くにはどうすれば良いでしょうか?

弟の借金問題で、弟の籍を抜きたいと思うのですが、父が亡くなっており、私は姉になるのですが、弟の籍を抜くのは難しいでしょうか?

弟様が、今後結婚したりして新たに戸籍を作る場合には、あなたの戸籍からは転籍することになります。

とはいえ、借金問題と戸籍の記載は通常なんの関係もありません。
借金問題のために籍を抜きたいというご希望自体、意味不明です。

弟様には、早めに法テラス等に相談し、債務整理や自己破産を行うように伝えておいてください。