不正請求をやらされていた。会社を訴えたい。

管理職の仕事をしていますが、上司の指示で不正請求をずっとやらされていました。
良心の呵責に耐えられず、退職する事になしましたが、
この会社を訴え、不正の存在を明らかにしたいと思っています。

ですが上司に不正の指示をされたという証拠はなく、
その上司にも
『そんな指示はしていない あいつが勝手にやった』
と言われてしまうと水掛け論になってしまいます。

また、不正請求を実行したのは私自身になるので逆に
訴えられてしまうのではないかとの不安もあります。

この場合、どのように立ち回れば訴える事が可能になるのでしょうか?
上司に指示されたという明確な証拠がないと訴える事は
出来ないのでしょうか?

会社に対して告発するのか、警察か、税務署か、どこですかね。
あなたは、上司の指示通りにやらざるを得ないのでしたら、とがめられる
ことはないでしょう。
どのように行動するかは、弁護士と直相談したほうがいいでしょう。