業務上横領について。

職場で業務上横領が横行しており、主動者を筆頭に複数人が関与しているのを知ってしまいました。
告発する場合、会社か警察どちらに先に言うべきですか?

また、主動で横領している人のみに処罰を求めることはできますか?
他の人は、主動者に無理やり合わせている可能性が高く、同じ処罰を受けるのは不公平だと感じているからです。

まずは、会社と協議でしょう。
証拠をつかむ必要があります。
会社および顧問弁護士(いれば)が刑事事件にしたほうがいい
と判断するなら、警察に被害申告するでしょう。
主犯格と追従者とでは、当然、扱いが異なるでしょう。
だからといって、追従者が責任を回避できることにはなりませんがね。