故意じゃないことを伝えたい

先日自動レジで誤って精算せずに店を出てしまって少し経って気づいてお店に電話をし支払いに戻って精算を済まして後日電話するかもしれませんと言われたところです
故意ではないことを理解してもらうにはどうすればよいですか

訂正 電話するかもしれない
→何かあったら電話します

故意ではないことを理解してもらうにはどうすればよいですか

「少し経って気づいてお店に電話をし支払いに戻って精算を済まして」という点を強調されることになると思います。
故意があれば、普通はお店に電話しないでしょうし、戻って精算もしないと思われるからです。