息子がバイト先のレジからお金を盗んだ

高校2年生の息子がバイト先でレジのお金を盗んでしまいました。
4回で合計2万円ほどと本人は言っていますがオーナーさんはかなりの回数で50万円は超えてると言います。
息子は身に覚えがないし画像を確認してもらってもいいと言っています。
オーナーさんはすごい剣幕でヤクザとか山に埋めるとか脅迫めいたことを息子に言ってきて息子はおびえています。
2万円以外の分の画像の証拠はありませんが、レジ取り消し分と棚卸しで出たマイナス分全て息子の仕業と言われています。
その分払えと。
証拠がない分の支払い義務はありますか?
もう警察に自首して正当に調べてもらった方がいいのか悩んでいます。

支払い義務はありませんが、慰謝料は支払うことになりますね。
脅迫もあるので、警察に申告したほうがいいでしょう。

やってない分に対しても慰謝料は発生するのでしょうか?
その場合いくらくらいですか?
相手が裁判を起こすと言うことですか?

やった分に関してです。
アバウト5~10万円位でしょうか。
裁判を起こすかどうかはわかりません。