自分の身の置き所がわかりません。

最近入社しました。しかしブラック企業で、不正な事をしています。また、自分は責任ある立場なため、正義を貫きたいですが、雇われのため、なかなか意見が通りません。上層部の意見にしたがうしかないのですが、悪に加担するのも嫌なので、どうしたらいいでしょうか?

時期をみて転職するといいでしょう。
疑われないように、体調の不良などを理由にして、
退職するといいでしょう。
計画倒産ならぬ計画退職がいいですね。