スマホの修理で、修理してない箇所まで、修理をした事にして費用を請求する。

上司が修理箇所を偽り、お客様に請求しています。

水没修理をした際に、画面も電源も起動しない為、画面・バッテリー・水没修理の費用が全部で、40.000円かかると説明

お客様は了承しました。

結果として、画面交換のみで解決

バッテリーも交換した事にして、費用を請求しました。

お客様は気づかない為に、どうする事もできませんが・・・

他にも、保護フィルムが割れただけなのに
画面交換しましたと偽り、費用を請求しました。

いくら売上の為とは言え
犯罪にはならないのでしょうか?

詐欺でしょう。
犯罪ですね。
告発もできるでしょう。
さらに上の上司らにも話すこともできるでしょう。
被害者に連絡を取り返金もできるでしょう。
どの方法がいいのかお考えください。