養育費公正証書について

養育費の取り決めについての公正証書を作成済みです。

子どもの口座に振り込むように指定していて、
銀行支店名・支店番号・口座番号・子どもの氏名が記載されています。

今後、私が再婚し子どもの苗字が変わり
振込先の口座は変わらず氏名のみが変更となった場合、
その公正証書はの効力はなくなってしまうのでしょうか?

支払義務はなくなりませんし、公正証書の効力もなくなりません。
銀行、支店名、口座番号がそのままであれば、事実上振込は可能ですし、ご心配であれば、口座名義が変更となった旨を先方に書面でお知らせになるとよいと思います。