給料保証でもらったお金は返さないとダメなんですか?

繁華街の飲食店の従業員をしており
コロナの影響で約2ヶ月半、お店が休業状態になり2月に1度だけ社長の方から給料保証10万円を頂きました。

ですが営業再開前にして精神疾患(うつ病等)を発症してしまい、出勤出来ず退店を申し出た所、辞めるなら保証金を返して欲しい。
と、言われました。
このことは、受け取りの際に説明されたわけでもなく、書面にサインもしておりません。退店の報告をしたらいきなり言われました。

返金しないといけないのでしょうか?
返さないなら被害届を出すとまで言われております。どうしたらいいでしょうか?

休業補償の趣旨であなたに渡したお金ですから、返済義務はなさそうですね。
だましたわけでもないので、被害届は受理されないですね。